Uso de códigos de barras para complementar la identificación de algunas especies aromáticas cultivadas en Colombia

Díaz López, Karenlyn Neylith

Uso de códigos de barras para complementar la identificación de algunas especies aromáticas cultivadas en Colombia

dc.contributor.advisor	Garzón Gutiérrez, Luz Nayibe
dc.contributor.advisor	Rondón González, Fernando
dc.contributor.advisor	Sepúlveda Castañeda, John Edinson
dc.contributor.author	Díaz López, Karenlyn Neylith
dc.contributor.evaluator	Arbeláez Cortés, Enrique
dc.date.accessioned	2023-07-27T20:05:19Z
dc.date.available	2023-07-27T20:05:19Z
dc.date.created	2023-07-27
dc.date.embargoEnd	2028-07-27
dc.date.issued	2023-07-27
dc.description.abstract	Las especies aromáticas poseen gran importancia para la comunidad científica y algunas industrias, debido a las propiedades biológicas de algunos subproductos metabólicos, por lo que la demanda de estas plantas ha aumentado progresivamente. Esta tendencia ha propiciado que se adulteren de manera intencional o no intencional las materias primas de los bioproductos. En algunos casos, las sustituciones ocurren por limitaciones en la determinación usando métodos tradicionales. Como resultado, las metodologías moleculares aplicadas como los códigos de barras de ADN constituyen una de las herramientas complementarias de gran utilidad para la determinación de individuos. Teniendo en cuenta lo anterior, se seleccionaron doce especies aromáticas, con escasa o nula información molecular que permitiera complementar su determinación taxonómica, algunas de estas especies con dificultades en su identificación por métodos morfológicos. Se planteó como objetivo general evaluar si los marcadores rbcL, matK, trnH-psbA e ITS permitían identificar las especies seleccionadas. Por esta razón, se estandarizaron las condiciones de amplificación por PCR de los marcadores mencionados y se determinó la eficiencia discriminatoria de las regiones propuestas implementando diferentes métodos analíticos. El análisis de BLASTn evidenció porcentajes bajos de discriminación en comparación a los análisis de Máxima Verosimilitud (MV). Los análisis de MV mostraron que el marcador ITS posee la mayor eficiencia discriminatoria en la asociación de terminales con sus clados putativos y se sugiere la implementación de análisis multilocus que incluyan esta región. Por otro lado, el análisis de brecha genética no evidenció un barcode gap informativo para ninguno de los marcadores propuestos. Finalmente, se resalta que estos resultados son relevantes debido a que proporcionan información valiosa para el conocimiento de la biodiversidad del país.
dc.description.abstractenglish	Aromatic species are of great importance to the scientific community and some industries, due to the biological properties of some metabolic by-products, which is why the demand for these plants has progressively progressed. This trend has led to the intentional or unintentional adulteration of bioproduct raw materials. In some cases, substitutions occur due to limitations in the determination using traditional methods. As a result, applied molecular methodologies such as DNA barcodes constitute one of the very useful complementary tools for the determination of individuals. Taking into account the above, twelve aromatic species were selected, with little or no molecular information that would allow complementing their taxonomic determination, some of these species with difficulties in their identification by morphological methods. The general objective was to evaluate whether the markers rbcL, matK, trnH-psbA and ITS allowed the identification of the selected species. For this reason, the PCR amplification conditions of the highlighted markers were standardized and the discriminatory efficiency of the proposed regions will be limited by implementing different analytical methods. The BLASTn analysis showed low discrimination percentages compared to the Maximum Likelihood (MV) analyses. The MV analyzes showed that the ITS marker has the highest discriminatory efficiency in the association of terminals with their putative clades and the implementation of multilocus analyzes that include this region is suggested. On the other hand, the genetic gap analysis does not show an informative barcode for any of the proposed markers. Finally, it is highlighted that these results are relevant because they provide valuable information for the knowledge of the country's biodiversity.
dc.description.degreelevel	Pregrado
dc.description.degreename	Biólogo
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.instname	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl	https://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.uri	https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/14619
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias
dc.publisher.program	Biología
dc.publisher.school	Escuela de Biología
dc.rights	info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar	http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.license	Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject	ITS
dc.subject	códigos de barras
dc.subject	plantas aromáticas
dc.subject	trnH-psbA
dc.subject	brecha genética
dc.subject	marcador molecular
dc.subject.keyword	ITS
dc.subject.keyword	barcodes
dc.subject.keyword	aromatic plants
dc.subject.keyword	trnH-psbA
dc.subject.keyword	genetic gap
dc.subject.keyword	molecular marker
dc.title	Uso de códigos de barras para complementar la identificación de algunas especies aromáticas cultivadas en Colombia
dc.title.english	Use of barcodes to complement the identification of some aromatic species cultivated in Colombia
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversion	http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.local	Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado