Evaluación de métodos de extracción de ADN y su efecto en la amplificación de marcadores moleculares de Ceratitis capitata (Diptera: Tephritidae) en Colombia

Valencia Rueda, Isabella

Evaluación de métodos de extracción de ADN y su efecto en la amplificación de marcadores moleculares de Ceratitis capitata (Diptera: Tephritidae) en Colombia

dc.contributor.advisor	Holguín Aranzazú, Claudia María
dc.contributor.advisor	Marchant Rojas, Sergio Andrés
dc.contributor.author	Valencia Rueda, Isabella
dc.contributor.evaluator	Fuentes Lorenzo, Jorge Luis
dc.date.accessioned	2023-11-01T12:53:24Z
dc.date.available	2023-11-01T12:53:24Z
dc.date.created	2023-10-31
dc.date.issued	2023-10-31
dc.description.abstract	El uso de herramientas moleculares ha permitido un avance significativo en el diagnóstico, monitoreo y control de plagas en cultivos agrícolas. Un paso fundamental para el éxito de estos procesos es el uso de métodos que permitan la identificación de especies de manera efectiva y a un bajo costo. La mosca del mediterráneo, Ceratitis capitata, es una plaga cuarentenaria reconocida a nivel mundial por su alta polifagia, atribuida principalmente a su alta capacidad de adaptación y dispersión. A pesar de la importancia de este insecto-plaga, en Colombia su diagnóstico en etapas larvales, y la realización de estudios poblacionales y filogenéticos son incipientes. Por este motivo, el objetivo de este trabajo fue estandarizar un método efectivo y eficiente para la extracción de ADN y amplificación de un marcador mitocondrial de C. capitata para las poblaciones de Colombia. Para esto, se comparó la efectividad del método de extracción CTAB con el kit comercial DNeasy en el aislamiento de ADN en cuatro tejidos (individuo adulto completo, cabeza-tórax, pata y estadio larval). A través de la visualización en geles de agarosa y la cuantificación del ADN, se encontró que ambos métodos de extracción son efectivos para la extracción de ADN de los diferentes tejidos, siendo el método CTAB más adecuado para obtener mayor cantidad ADN, mientras que el kit DNeasy permite una menor contaminación. Los dos métodos evaluados permitieron obtener producto PCR adecuado para secuenciación del marcador mitocondrial N4N5. Al considerar las ventajas del método de extracción utilizando CTAB con un bajo costo por muestra y alta efectividad, se recomienda el método CTAB para el estudio molecular de C. capitata en Colombia. Se espera que este estudio sea parte fundamental para el estudio genético de esta importante plaga a nivel nacional.
dc.description.abstractenglish	The use of molecular tools has allowed significant progress in the diagnosis, monitoring and control of pests in agricultural crops. A fundamental step for the success of these processes is the use of methods that allow the species identification in an effective and low-cost manner. The Mediterranean fruit fly, Ceratitis capitata, is a quarantine pest recognized worldwide for its high polyphagia, mainly attributed to its high capacity for adaptation and dispersal. Despite the importance of this insect-pest, in Colombia its diagnosis in larval stages, and studies on population genetics and phylogeny are incipient. For this reason, the objective of this work was to standardize an effective and efficient method for DNA extraction and amplification of a mitochondrial marker of C. capitata for Colombian populations. For this purpose, the effectiveness of the CTAB extraction method was compared with the commercial kit DNeasy in the isolation of DNA in four tissues (complete adult, head-thorax, leg and larval stage). Through visualization in agarose gels and DNA quantification, it was found that both extraction methods are effective for DNA extraction from the different tissues, with the CTAB method being more suitable for obtaining more DNA, while the DNeasy kit allows less contamination. These two methods allowed obtaining PCR product suitable for sequencing of the mitochondrial marker N4N5. Considering the advantages of the extraction method using CTAB with a low cost per sample and high effectiveness, the CTAB method is recommended for the molecular study of C. capitata in Colombia. It is expected that this study will be a fundamental part of the genetic study of this important pest at the national level.
dc.description.degreelevel	Pregrado
dc.description.degreename	Biólogo
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.instname	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.reponame	Universidad Industrial de Santander
dc.identifier.repourl	https://noesis.uis.edu.co
dc.identifier.uri	https://noesis.uis.edu.co/handle/20.500.14071/15072
dc.language.iso	spa
dc.publisher	Universidad Industrial de Santander
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias
dc.publisher.program	Biología
dc.publisher.school	Escuela de Biología
dc.rights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.accessrights	info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.coar	http://purl.org/coar/access_right/c_abf2
dc.rights.creativecommons	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0)
dc.rights.license	Atribución-NoComercial-SinDerivadas 2.5 Colombia (CC BY-NC-ND 2.5 CO)
dc.rights.uri	http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subject	Diagnóstico molecular
dc.subject	Genética
dc.subject	Mosca del mediterráneo
dc.subject	PCR
dc.subject.keyword	Molecular identification
dc.subject.keyword	Genetics
dc.subject.keyword	Mediterranean fruit fly
dc.subject.keyword	PCR
dc.title	Evaluación de métodos de extracción de ADN y su efecto en la amplificación de marcadores moleculares de Ceratitis capitata (Diptera: Tephritidae) en Colombia
dc.title.english	Assessment of DNA extraction methods and their effect on the amplification of molecular markers of Ceratitis capitata (Diptera: Tephritidae) in Colombia
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.hasversion	http://purl.org/coar/version/c_b1a7d7d4d402bcce
dc.type.local	Tesis/Trabajo de grado - Monografía - Pregrado